马军（1962.7.15- ），生于黑龙江省宁安市，男，汉族，山东省莘县人。水处理专家。1982年毕业于哈尔滨建筑工程学院给水排水工程专业（现哈尔滨工业大学），并获该校硕士、博士学位。同济大学、英国帝国理工学院博士后。现任哈尔滨工业大学环境学院副院长，教授、博导，国际水协会刊Water Research 副主编，国际水协水厂设计与运行委员会副主席。

从事水处理理论与技术研究与教学工作，创建了不同价态铁锰氧化剂除污染理论体系，开发出高锰酸盐和高铁酸盐预氧化除污染技术、臭氧催化氧化深度处理技术、基于新生态微界面特性的强化除重金属技术和纳米复合膜水处理技术、过硫酸盐高级氧化技术等，应用于受污染水源水净化工程、污水深度处理及回用工程，在多次重大污染应急工程中发挥了重要作用。英国皇家化学会会士。培养博士51人，硕士38人，其中2人获全国优秀博士论文奖，2人获全国优秀博士论文提名奖。获中国青年科学家奖、“长江学者”成就奖（工程科学奖）、英国皇家化学会“可持续发展水奖”、美国化学会“科学卓越荣誉奖”。获国家技术发明奖二等奖2项(排名1)，黑龙江省自然科学一等奖1项(排名1)、黑龙江省技术发明一等奖3项(均排名1)；发表SCI论文280篇，获发明专利120项、美国专利6项。

2019年当选中国工程院院士。