根据联邦德国的政体，即各州对本州的文化事务负有独立的责任，以及由于历史上的原因，至今没有一个全国性的科学院。德国的科学院是州属的，基本预算完全由各州承担。在17、18世纪欧洲近代科学院运动的大背景下，建立了德国自然与人文科学院联盟（下称“德国科学院联盟”）。
它的第一个科学院是一个专门的科学家联盟，初始成立于1652年，1687年升级为王国科学院，称为德国利奥波特自然科学家科学院。此外还有设在哈勒的德国雷奥波尔迪纳自然研究院，但它不是“德国科学院联盟”的会员。这些科学院只是一所养护科学发展的论坛。
“德国科学院联盟”是统一协调7个科学院研究工作的联盟组织，在科学和社会之间起中介作用。
科学院联盟是促进科学发展的良好平台，其主要责任是：通过跨领域的合作促进思想和研究的发展。各个科学院在科学和社会之间起着中介的作用，它们积极参与科学院联盟的工作，同时科学院联盟还是国际科学合作研究的联系机构。
德国科学院有350余年历史，现有1400名院士和通讯院士。其院士成员主要来自德语区国家（德国、奥地利、瑞士），约四分之一院士来自其他国家。
科学院联盟的管理机构由理事会、院士大会（主席团）、执行委员会和主席组成。院士大会每年至少召开一次，其任务包括听取理事会的报告，并检查职责履行情况、决定预算、批准新院士的加入、投票决定制度的修订等。执行委员会由联盟的主席和副主席组成，其中任何一人均可以独自代表该联盟。
每个科学院都是独立的法人，基本都分为两个学部，即人文社会科学部和自然科学部。“德国科学院联盟”有7家科学院，它们集中在美茵茨的“德国科学院联盟”的旗帜之下，开展研究工作。
这7家科学院是：北莱茵一威斯特法伦科学院，坐落在杜塞尔多夫；巴伐利亚科学院，坐落在慕尼黑；柏林一勃兰登堡科学院；萨克森科学院，坐落在莱比锡；海德堡科学院；哥廷根的科学院；美茵茨的科学文学院。科学院联盟成员包括院士、通讯院士和名誉院士。每个科学院院土都是那些在研究工作上对开拓本学科知识作出了杰出贡献的学者。
目前，科学院联盟设有院士、通讯院士和名誉院士，共有1400名。
院士有义务参加他们所在学部的会议和科学院全体会议，有权参与科学院的工作，但超过68岁的院士可不履行这个义务。通讯院士和名誉院士可参加学部的全体会议和学术会议。
通讯院士和名誉院士的任期都是终身的，院士和名誉院士都可以自愿退出科学院，退出者需书面解释其退出的原因。院士和名誉院士如果被德国某一法院（具有法律效力和审判资格的法院）判以刑罚，或者由于受到刑事判决不再享有公开选举权利的，则不能再被授予公职，并需退出科学院。如果院士和名誉院士侵犯科学院的利益，妨碍科学院目标的实现，或被证实犯有严重失职等重大错误时，将被开除。院士的除名根据主席团的建议在全体大会上通过。院士除名的表决是用无记名投票的方式进行的，只要2/3以上的与会者同意除名决定就可生效。凡有突出科技成就的学者，均可成为科学院院士或通讯院士。院士当选之后，如工作地点变动，不在本州内时，则院士自动成为通讯院士（美茵茨科学文学院没有这项规定）。相反，通讯院士由于工作地点变动到本州内时，则自动成为院士。每个学部年龄在68岁以下的院士人数有限定，一般不得超过50名，通讯院士的人数则不做限制。凡为科学院工作立下卓越功绩的著名学者或给予科学院大力赞助的社会活动家，都可被授予名誉院士的称号。名誉院士人数不得超过10名。院士和通讯院士的选举均在学部内进行。院士提名的候选人只能限于本学科。当学部有3/4以上有选举权的院士出席，并获得2/3最低票数时，候选人就当选为院士或通讯院士。每次投放的名额，根据各学部（学科）68岁以下院士的最低空缺人数情况决定。德国马克斯·普朗克科学促进学会（简称马普学会）是德国政府资助的全国性研究机构，成立于1948年2月，其前身是成立于1911年的威廉皇家学会。马普学会是德国最大的研究机构，现有79个研究所和研究中心，人员1万2千多人，主要从事自然科学、人文科学和社会科学的基础研究。马普学会在世界科学界享有很高的声望。1954年以来，德国有30名诺贝尔奖获得者，其中一半来自马普学会。
德国作为科技强国一向重视向公众普及最新的科学进展和发明，德国政府有重视科普宣传的优良传统，公众也有热爱科学和崇尚科学研究的习惯，这也是德国长期保持科技强国、科技大国的重要原因之一，这从德国政府在科普工作方面的做法就能得出这样的结论。2000年以来，联邦政府每年发起“科学年”活动，每年围绕一个主题开展科普宣传活动，“物理年”、“生命科学年”、“地理学年”、“化学年”、“技术年”、“信息年”一个个闪亮登场。2005年德国的科普宣传是以“爱因斯坦年”为主线的，以历史和科学史上的人物作为科学年的核心还是第一次。活动搞得相当隆重，内容丰富多彩，公众参与面广，在德国产生极大的影响，取得了良好的效果。在柏林的“爱因斯坦年”开幕式上，德国总理施罗德盛赞爱因斯坦是科学家的榜样，希望媒体对那些深奥无比的课题，如纳米、生物技术、医学技术等进行更多的大众科普知识的阐述和传播。为了加速培养青年科技人才，德国成立了“青年科学院”。该“青年科学院”挂靠在柏林一勃兰登堡科学院和哈勒德国科学院，现已挑选20名男女优秀科学工作者作为其首批成员，并已从国家科研部获得约400万马克（约合200万美元）的启动资金和5年的研究课题。
青年科技工作者获得博士后均可成为“青年科学院”的成员，他们可以在那里完全独立地进行科研工作。德国科研部长指出，“青年科学院”的成立为那些有天赋的青年科技工作者充分发挥聪明才智与创造力提供了良好的条件。
